国家土地管理局1995年第3号文《土地违法案件查处办法》第四章规定：

经批准立案的案件，土地管理部门应当及时指派承办人,承办人应当全面、客观、公正地调查、收集有关证据,承办人调查取证时，不得少于两人，并应当向被调查人出示土地执法证件。

承办人可以向当事人、证人或者关系人提出询问，并应当制作询问笔录。询问笔录由被调查人阅读或者向其宣读，并由调查人和被调查人签名或者盖章。

承办人在必要时，可以勘验物证或者现场,勘验物证或者现场，勘验人员应当邀请有关组织或者人员参加,勘验人员勘验时，可以对物证或者现场进行拍照和测量。对勘验情况和结果应当制作笔录，由勘验人员、见证人和当事人签名或者盖章,当事人拒绝参加的，不影响勘验的进行。

证据有下列几种：

(一)物证；

(二)书证；

(三)视听材料；

(四)证人证言；

(五)当事人陈述；

(六)调查笔录和勘测笔录；

(七)鉴定结论；

(八)其他。

承办人必须认真鉴别上述证据，未经查证属实，不得作为认定事实的根据。

经立案调查认定有违法行为的，土地管理部门应当及时发出《责令停止土地违法行为通知书》，送达当事人。

承办人在案件调查结束后，应当根据事实和法律、法规，提出《土地违法案件调查报告》。

土地违法案件应当由土地管理部门领导集体审议，但实行行政首长负责制。审议应当制作笔录，由参加审议的成员签名。审议中的不同意见，应当如实记入笔录，并将笔录归入案卷。

经审议的土地违法案件，土地管理部门应当分别情况予以处理：

(一)认定举报不实或者证据不足，未发现违法事实的，发出《撤销立案决定书》，立案予以撤销，重大案件的撤销应当报上一级人民政府土地管理部门备案；

(二)认定违法事实清楚，证据确凿的，依法作出行政处罚决定，发出《土地侵权案件行为处罚决定书》，送达当事人；

(三)认定侵犯土地的所有权或者使用权的，依法作出处理决定，发出《土地侵权行为处理决定书》，送达当事人；

(四)认定当事人拒绝、阻碍土地管理工作人员依法执行职务的，应当提请公安机关处理；

(五)认定国家工作人员违法，依法应当给予行政处分的，应当提出书面建议并附调查报告和有关证据，移送当事人所在单位或者上级机关处理，处理结果应当抄送移送案件的机关；

(六)认定违法行业构成犯罪的，应当将案件及时移送司法机关依法追究刑事责任。

在土地违法案件调查处理过程中，承办人、主管领导有下列情形之一的，应当回避：

(一)与被调查人有近亲属关系的；

(二)本人或者近亲属与本案有利害关系的；

(三)与本案当事人有其他关系，可能影响公正查处案件的。

承办人员的回避，由主管领导决定；主管领导的回避，由案件处理机关的领导集体决定或者报上一级机关决定。